Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD1P28289 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD1P28289 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms