Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA2P26232 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA2P26232 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA2P26232 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms