Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNE1P24864 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE1P24864 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms