Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFYAP23511 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFYAP23511 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFYAP23511 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFYAP23511 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFYAP23511 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFYAP23511 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFYAP23511 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFYAP23511 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFYAP23511 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFYAP23511 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFYAP23511 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFYAP23511 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFYAP23511 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFYAP23511 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFYAP23511 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFYAP23511 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFYAP23511 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFYAP23511 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFYAP23511 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFYAP23511 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFYAP23511 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFYAP23511 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms