Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHP20382 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMCHP20382 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHP20382 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHP20382 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHP20382 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMCHP20382 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMCHP20382 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHP20382 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHP20382 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHP20382 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHP20382 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMCHP20382 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMCHP20382 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMCHP20382 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMCHP20382 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMCHP20382 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMCHP20382 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms