Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB6AP20340 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6AP20340 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms