Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH2P19022 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH2P19022 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH2P19022 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH2P19022 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH2P19022 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH2P19022 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH2P19022 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH2P19022 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH2P19022 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH2P19022 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH2P19022 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH2P19022 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH2P19022 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH2P19022 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH2P19022 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH2P19022 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH2P19022 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH2P19022 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH2P19022 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH2P19022 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.9 ms