Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL17P18621 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL17P18621 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL17P18621 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL17P18621 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL17P18621 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL17P18621 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL17P18621 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL17P18621 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL17P18621 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL17P18621 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL17P18621 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL17P18621 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL17P18621 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL17P18621 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL17P18621 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL17P18621 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL17P18621 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL17P18621 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL17P18621 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL17P18621 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL17P18621 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL17P18621 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL17P18621 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL17P18621 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL17P18621 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL17P18621 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL17P18621 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL17P18621 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL17P18621 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL17P18621 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL17P18621 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17P18621 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17P18621 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17P18621 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPL17P18621 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17P18621 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17P18621 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17P18621 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17P18621 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17P18621 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17P18621 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17P18621 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms