Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB6P18564 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms