Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA1P17302 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA1P17302 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA1P17302 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA1P17302 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA1P17302 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA1P17302 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA1P17302 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA1P17302 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA1P17302 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA1P17302 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA1P17302 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA1P17302 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA1P17302 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA1P17302 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA1P17302 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA1P17302 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA1P17302 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA1P17302 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA1P17302 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA1P17302 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA1P17302 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA1P17302 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA1P17302 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA1P17302 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA1P17302 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA1P17302 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA1P17302 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA1P17302 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA1P17302 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA1P17302 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA1P17302 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA1P17302 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA1P17302 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA1P17302 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA1P17302 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA1P17302 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA1P17302 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA1P17302 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA1P17302 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA1P17302 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA1P17302 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms