Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE6AP16499 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms