Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPNP16150 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNP16150 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNP16150 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNP16150 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNP16150 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNP16150 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPNP16150 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPNP16150 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNP16150 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNP16150 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNP16150 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPNP16150 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNP16150 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNP16150 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNP16150 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPNP16150 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNP16150 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNP16150 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNP16150 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNP16150 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNP16150 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNP16150 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPNP16150 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNP16150 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNP16150 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNP16150 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNP16150 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNP16150 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNP16150 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNP16150 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNP16150 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNP16150 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNP16150 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNP16150 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms