Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFHP12036 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFHP12036 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFHP12036 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFHP12036 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFHP12036 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFHP12036 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFHP12036 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFHP12036 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFHP12036 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFHP12036 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFHP12036 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFHP12036 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFHP12036 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFHP12036 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFHP12036 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFHP12036 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFHP12036 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFHP12036 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFHP12036 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFHP12036 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFHP12036 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFHP12036 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFHP12036 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFHP12036 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFHP12036 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFHP12036 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFHP12036 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFHP12036 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFHP12036 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFHP12036 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFHP12036 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEFHP12036 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFHP12036 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms