Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT3P12035 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT3P12035 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT3P12035 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT3P12035 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT3P12035 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT3P12035 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT3P12035 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT3P12035 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT3P12035 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT3P12035 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT3P12035 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT3P12035 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT3P12035 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT3P12035 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT3P12035 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT3P12035 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT3P12035 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT3P12035 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT3P12035 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT3P12035 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT3P12035 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT3P12035 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT3P12035 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT3P12035 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT3P12035 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT3P12035 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT3P12035 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT3P12035 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms