Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYGBP11216 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYGBP11216 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYGBP11216 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYGBP11216 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYGBP11216 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYGBP11216 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYGBP11216 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PYGBP11216 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYGBP11216 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYGBP11216 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYGBP11216 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYGBP11216 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYGBP11216 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYGBP11216 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYGBP11216 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYGBP11216 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYGBP11216 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYGBP11216 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PYGBP11216 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PYGBP11216 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYGBP11216 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYGBP11216 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYGBP11216 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYGBP11216 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGBP11216 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGBP11216 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGBP11216 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGBP11216 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGBP11216 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGBP11216 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGBP11216 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms