Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2P10911 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2P10911 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2P10911 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCF2P10911 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCF2P10911 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCF2P10911 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2P10911 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2P10911 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2P10911 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2P10911 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2P10911 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2P10911 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2P10911 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2P10911 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2P10911 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2P10911 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2P10911 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2P10911 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2P10911 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2P10911 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2P10911 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2P10911 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2P10911 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2P10911 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2P10911 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2P10911 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2P10911 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2P10911 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2P10911 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2P10911 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2P10911 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2P10911 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2P10911 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2P10911 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2P10911 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2P10911 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2P10911 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2P10911 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2P10911 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCF2P10911 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2P10911 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2P10911 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2P10911 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2P10911 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2P10911 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2P10911 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2P10911 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2P10911 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms