Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2F1P10589 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms