Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL3P10147 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL3P10147 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL3P10147 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL3P10147 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL3P10147 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL3P10147 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL3P10147 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL3P10147 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL3P10147 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL3P10147 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL3P10147 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL3P10147 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL3P10147 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL3P10147 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL3P10147 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL3P10147 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL3P10147 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL3P10147 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL3P10147 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCL3P10147 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3P10147 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3P10147 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3P10147 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3P10147 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3P10147 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3P10147 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3P10147 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3P10147 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3P10147 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3P10147 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3P10147 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3P10147 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3P10147 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3P10147 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3P10147 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3P10147 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3P10147 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3P10147 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3P10147 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3P10147 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3P10147 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3P10147 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3P10147 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3P10147 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3P10147 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3P10147 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3P10147 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3P10147 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL3P10147 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL3P10147 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL3P10147 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL3P10147 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL3P10147 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL3P10147 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3P10147 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3P10147 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3P10147 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3P10147 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3P10147 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3P10147 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3P10147 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3P10147 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3P10147 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3P10147 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3P10147 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3P10147 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3P10147 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3P10147 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms