Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC172P0C7W6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC172P0C7W6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms