Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAA1P09110 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms