Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC2P02585 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms