Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MBD3O95983 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MBD3O95983 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MBD3O95983 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MBD3O95983 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MBD3O95983 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MBD3O95983 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MBD3O95983 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MBD3O95983 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD3O95983 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD3O95983 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD3O95983 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD3O95983 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD3O95983 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD3O95983 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD3O95983 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD3O95983 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD3O95983 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD3O95983 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD3O95983 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD3O95983 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD3O95983 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD3O95983 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD3O95983 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD3O95983 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD3O95983 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD3O95983 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD3O95983 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD3O95983 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD3O95983 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD3O95983 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD3O95983 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD3O95983 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD3O95983 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD3O95983 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD3O95983 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD3O95983 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD3O95983 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD3O95983 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD3O95983 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD3O95983 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD3O95983 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD3O95983 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD3O95983 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD3O95983 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD3O95983 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD3O95983 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD3O95983 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD3O95983 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD3O95983 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD3O95983 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD3O95983 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD3O95983 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD3O95983 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD3O95983 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD3O95983 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD3O95983 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD3O95983 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD3O95983 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms