Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STAMBPO95630 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms