Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN4O95460 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN4O95460 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN4O95460 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN4O95460 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN4O95460 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN4O95460 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN4O95460 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN4O95460 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN4O95460 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN4O95460 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN4O95460 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN4O95460 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN4O95460 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN4O95460 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN4O95460 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN4O95460 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN4O95460 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN4O95460 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN4O95460 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN4O95460 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN4O95460 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN4O95460 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN4O95460 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN4O95460 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN4O95460 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN4O95460 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN4O95460 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN4O95460 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN4O95460 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN4O95460 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN4O95460 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN4O95460 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN4O95460 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN4O95460 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN4O95460 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN4O95460 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN4O95460 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms