Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP1O94782 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP1O94782 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP1O94782 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP1O94782 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP1O94782 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP1O94782 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP1O94782 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP1O94782 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP1O94782 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP1O94782 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP1O94782 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP1O94782 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP1O94782 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP1O94782 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP1O94782 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP1O94782 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP1O94782 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP1O94782 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP1O94782 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP1O94782 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP1O94782 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP1O94782 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP1O94782 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP1O94782 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP1O94782 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP1O94782 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP1O94782 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP1O94782 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP1O94782 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP1O94782 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP1O94782 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP1O94782 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP1O94782 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP1O94782 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP1O94782 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP1O94782 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP1O94782 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP1O94782 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP1O94782 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP1O94782 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP1O94782 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP1O94782 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP1O94782 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP1O94782 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP1O94782 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP1O94782 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP1O94782 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP1O94782 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP1O94782 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP1O94782 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms