Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA10O75578 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms