Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH16O75309 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH16O75309 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH16O75309 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH16O75309 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH16O75309 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH16O75309 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH16O75309 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH16O75309 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH16O75309 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH16O75309 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH16O75309 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH16O75309 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH16O75309 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH16O75309 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH16O75309 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH16O75309 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH16O75309 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH16O75309 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH16O75309 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH16O75309 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH16O75309 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH16O75309 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH16O75309 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH16O75309 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH16O75309 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH16O75309 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH16O75309 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH16O75309 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH16O75309 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH16O75309 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH16O75309 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH16O75309 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH16O75309 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH16O75309 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH16O75309 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH16O75309 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH16O75309 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH16O75309 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH16O75309 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH16O75309 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH16O75309 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH16O75309 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH16O75309 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH16O75309 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH16O75309 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH16O75309 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH16O75309 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH16O75309 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH16O75309 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH16O75309 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH16O75309 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH16O75309 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH16O75309 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH16O75309 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH16O75309 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH16O75309 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH16O75309 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms