Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3O43889 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3O43889 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3O43889 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3O43889 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3O43889 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3O43889 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3O43889 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3O43889 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3O43889 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3O43889 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3O43889 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3O43889 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3O43889 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3O43889 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3O43889 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3O43889 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3O43889 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3O43889 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3O43889 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3O43889 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3O43889 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3O43889 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3O43889 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3O43889 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3O43889 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3O43889 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3O43889 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3O43889 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3O43889 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3O43889 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3O43889 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3O43889 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3O43889 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3O43889 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3O43889 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3O43889 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3O43889 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3O43889 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3O43889 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3O43889 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3O43889 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms