Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC28A2O43868 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms