Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK2O43353 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK2O43353 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK2O43353 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms