Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51BO15315 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51BO15315 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51BO15315 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms