Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBDO15205 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBDO15205 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBDO15205 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBDO15205 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBDO15205 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBDO15205 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBDO15205 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBDO15205 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBDO15205 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBDO15205 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBDO15205 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBDO15205 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBDO15205 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBDO15205 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBDO15205 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBDO15205 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBDO15205 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBDO15205 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBDO15205 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBDO15205 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBDO15205 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBDO15205 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBDO15205 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBDO15205 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBDO15205 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBDO15205 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBDO15205 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBDO15205 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBDO15205 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms