Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCF2LO15068 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2LO15068 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms