Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNJ2O15056 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SYNJ2O15056 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.76■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNJ2O15056 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SYNJ2O15056 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SYNJ2O15056 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SYNJ2O15056 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms