Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN9O14815 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms