Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP2O14595 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2O14595 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2O14595 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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