Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPEO14579 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPEO14579 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPEO14579 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPEO14579 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPEO14579 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPEO14579 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPEO14579 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPEO14579 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPEO14579 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPEO14579 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPEO14579 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPEO14579 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPEO14579 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPEO14579 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPEO14579 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPEO14579 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPEO14579 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPEO14579 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPEO14579 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPEO14579 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPEO14579 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPEO14579 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPEO14579 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPEO14579 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPEO14579 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPEO14579 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPEO14579 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPEO14579 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPEO14579 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COPEO14579 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COPEO14579 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPEO14579 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPEO14579 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPEO14579 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPEO14579 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPEO14579 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPEO14579 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPEO14579 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPEO14579 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPEO14579 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPEO14579 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPEO14579 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPEO14579 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPEO14579 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPEO14579 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPEO14579 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPEO14579 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPEO14579 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPEO14579 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms