Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DFFAO00273 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DFFAO00273 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DFFAO00273 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DFFAO00273 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DFFAO00273 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DFFAO00273 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DFFAO00273 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DFFAO00273 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DFFAO00273 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DFFAO00273 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DFFAO00273 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DFFAO00273 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DFFAO00273 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DFFAO00273 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DFFAO00273 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DFFAO00273 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DFFAO00273 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DFFAO00273 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DFFAO00273 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DFFAO00273 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DFFAO00273 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DFFAO00273 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DFFAO00273 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DFFAO00273 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DFFAO00273 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DFFAO00273 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DFFAO00273 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DFFAO00273 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DFFAO00273 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DFFAO00273 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DFFAO00273 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DFFAO00273 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DFFAO00273 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DFFAO00273 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DFFAO00273 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DFFAO00273 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DFFAO00273 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DFFAO00273 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DFFAO00273 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DFFAO00273 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DFFAO00273 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DFFAO00273 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DFFAO00273 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DFFAO00273 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DFFAO00273 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DFFAO00273 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DFFAO00273 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DFFAO00273 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DFFAO00273 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DFFAO00273 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DFFAO00273 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DFFAO00273 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DFFAO00273 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DFFAO00273 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DFFAO00273 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DFFAO00273 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DFFAO00273 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DFFAO00273 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DFFAO00273 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DFFAO00273 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms