Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3BRM9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3BRM9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3BRM9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3BRM9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3BRM9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H3BRM9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H3BRM9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H3BRM9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3BRM9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3BRM9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3BRM9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3BRM9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3BRM9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H3BRM9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BRM9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BRM9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BRM9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BRM9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BRM9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BRM9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BRM9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BRM9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BRM9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms