Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BN98 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BN98 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BN98 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BN98 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BN98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BN98 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BN98 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BN98 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BN98 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BN98 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BN98 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BN98 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BN98 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BN98 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BN98 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BN98 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BN98 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BN98 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BN98 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BN98 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BN98 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BN98 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BN98 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BN98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BN98 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BN98 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BN98 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BN98 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BN98 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BN98 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BN98 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BN98 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms