Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms