Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HHLA1C9JL84 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms