Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRDCB7Z8K6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRDCB7Z8K6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRDCB7Z8K6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms