Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DEV8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DEV8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DEV8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DEV8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DEV8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DEV8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DEV8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DEV8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DEV8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DEV8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DEV8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DEV8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DEV8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DEV8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DEV8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DEV8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DEV8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DEV8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DEV8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DEV8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DEV8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DEV8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DEV8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DEV8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DEV8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
B4DEV8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms