Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPBD1B2RD01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPBD1B2RD01 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms