Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC169A6NNP5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC169A6NNP5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms