Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGPD3A6NKT7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD3A6NKT7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms