Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PSDA5PKW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms