Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA8A3KMH1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VWA8A3KMH1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA8A3KMH1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms