Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO3A2RU48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms